特発性好酸球増多症候群は，臓器機能不全と関連した持続的な好酸球増加状態を伴う．その原因は不明である．この症候群の患者の，イマチニブに対する反応に関する最近の報告では，ABL，血小板由来成長因子受容体（PDGFR），KIT といった，イマチニブに阻害される活性化されたキナーゼが原因である可能性が示唆されている．

好酸球増多症候群患者 11 例にイマチニブを投与し，反応の分子的基礎を確認した．

イマチニブで治療した患者 11 例中 9 例が 3 ヵ月以上継続する反応を示し，好酸球数が正常に回復した．このような患者のうち 1 例は複雑な染色体異常を有しており，染色体 4q12 の中間部欠失により生じた，Fip1 様 1（FIP1L1）遺伝子と PDGFR α（PDGFRA）遺伝子の融合が同定された．FIP1L1-PDGFR α は，恒常的に活性化されているチロシンキナーゼであり，造血細胞を形質転換させ，イマチニブにより阻害される（50%阻害濃度，3.2 nM）．FIP1L1-PDGFRA 融合遺伝子は，特発性好酸球増多症候群患者 16 例中 9 例にも検出され，3 ヵ月間以上継続してイマチニブに反応を示した患者では，9 例中 5 例に検出された．患者 1 例での再発は，イマチニブに対する抵抗性を付与する PDGFRA の T674I 突然変異の出現と関連していた．

好酸球増多症候群は，染色体の中間部欠失により生じた新しい融合チロシンキナーゼ，FIP1L1-PDGFR α に起因する可能性がある．再発時に T674I 耐性突然変異が起きていたことは，FIP1L1-PDGFR α がイマチニブの標的であることを示している．われわれのデータは，遺伝子の欠失により，機能が付加される融合蛋白が生成される可能性を示している．