コレラは 1991 年以降中南米での発生が認められているが，少なくとも 100 年間ハイチでの流行はなかった．しかし最近，ハイチでコレラの深刻な集団感染が起きている．

第三世代の単一分子リアルタイム DNA 解析を用いて，現在ハイチで集団感染を引き起こしているコレラ菌（Vibrio cholerae）の臨床分離株 2 株，1991 年に中南米でコレラを引き起こした 1 株，2002 年と 2008 年に南アジアで分離された 2 株のゲノム配列を決定した．一次配列データを用いて，これら 5 株のゲノムと，これまでに得られた 23 種類の V. cholerae 株の部分的ゲノム配列を比較し，ハイチのコレラ集団感染の起源と考えられる菌株を評価した．

一塩基変異と，超可変性染色体要素の存在および構造から，ハイチの分離株と，2002 年と 2008 年にバングラデシュで分離された V. cholerae El Tor O1 変異株との強い類似性が示唆された．一方で，ハイチの分離株のゲノム変異解析から，南米でみられる分離株との類似性は弱いことが判明した．

ハイチでの流行はおそらく，地理的に遠く離れた発生源から，人間活動を介して，V. cholerae 株がもたらされた結果である．（米国国立アレルギー感染症研究所，ハワード・ヒューズ医学研究所から研究助成を受けた．）